Process Seurat seurat.object through PCA

Source: R/seurat_wrappers.R

Process Seurat seurat.object through PCA

ReduceDims(seurat.obj, n.var.features = 2000, n.pcs = 50, remove.genes, ...)

Arguments

seurat.obj

Seurat object
n.var.features

of variable features to use
n.pcs

of PCs to use
remove.genes

Genes to remove from variable features and PCA

Value